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蛋白質組（Proteome）一詞源于蛋白質（protein）與 基因組（genome）兩個詞的組合，意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”，即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組與轉錄組有許多相似之處，也具有時空特異性，會隨著環境、組織或個體的改變而改變。
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